[bio] Baker design pipeline

先用RFdiffusion得到一个可以bind target protein的结构，但是RFdiffusion给出的序列并不是optimized。

接下来要优化序列，proteinMPNN 和evo2都可以做：结构-->氨基酸序列 的预测。

之后用AF3看一些氨基酸预测出来的结构是否正确（和RFdiffusion bind target protein的结构一致）。

最后用gromacs模拟一下结合。